Ce spectrophotomètre de masse PDZ, modèle E2 MI-S, est composé d'une pompe turbo moléculaire et d'une pompe rotative servant à capter puis à envoyer du gaz composé de CO² et N² (Dioxyde de Carbone et Di-Azote) dans un champ électromagnétique. Ces molécules sont ensuite bombardées par des électrons pour ionisation après accélération dans un champ électrique. Cette technique permet de séparer les molécules en fonction de leur masse et d'isoler des isotopes (N14/15 et C12/13). Après détection à la sortie du champ magnétique et calcul par un logiciel des quantités relatives d'isotopes, l'utilisateur peut tirer des conclusions sur l'état des réseaux trophiques. Cette technique est utilisée en aval d'une série de nébulisations (méthode DUMAS) : le spectrophotomètre de masse est couplé avec un analyseur élémentaire et une unité de combustion automatisée. Les échantillons à traiter passent dans un four de 1000°C puis dans un second four à cuivre afin d'en extraire du CO² et du N², puis dans une colonne à chromatographie gazeuse (Hélium) pour la séparation de ces molécules.